Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc2Q9D485 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhc2Q9D485 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms