Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a4cQ9D3F6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms