Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp5Q9D387 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp5Q9D387 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms