Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ankrd39Q9D2X0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ankrd39Q9D2X0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms