Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1bQ9D1G1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab1bQ9D1G1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab1bQ9D1G1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms