Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syf2Q9D198 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms