Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snu13Q9D0T1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snu13Q9D0T1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms