Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exosc7Q9D0M0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exosc7Q9D0M0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms