Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Elp3Q9CZX0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Elp3Q9CZX0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Elp3Q9CZX0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms