Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc77Q9CZH8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc77Q9CZH8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms