Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nde1Q9CZA6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nde1Q9CZA6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms