Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gins3Q9CY94 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins3Q9CY94 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms