Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChtopQ9CY57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChtopQ9CY57 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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