Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgo1Q9CXH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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