Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xrcc3Q9CXE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms