Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Utp23Q9CX11 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Utp23Q9CX11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms