Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RpainQ9CWY9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RpainQ9CWY9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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