Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgpep1lQ9CWB5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1lQ9CWB5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms