Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930553M12RikQ9CUH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930553M12RikQ9CUH1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms