Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms