Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem42Q9CR22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms