Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sec61bQ9CQS8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sec61bQ9CQS8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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