Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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