Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpb2Q9CQI7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms