Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Rab5aQ9CQD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rab5aQ9CQD1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rab5aQ9CQD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5aQ9CQD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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