Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ94

Dnajc5b, DnaJ homolog subfamily C member 5B, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc5bQ9CQ94 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Dnajc5bQ9CQ94 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc5bQ9CQ94 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnajc5bQ9CQ94 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms