Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim26Q99PN3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms