Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scd3Q99PL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scd3Q99PL7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scd3Q99PL7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms