Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NsmfQ99NF2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NsmfQ99NF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsmfQ99NF2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms