Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pcgf6Q99NA9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pcgf6Q99NA9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcgf6Q99NA9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms