Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl3Q99N95 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl3Q99N95 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl3Q99N95 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl3Q99N95 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms