Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac9Q99N13 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac9Q99N13 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac9Q99N13 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms