Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd1Q99MV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd1Q99MV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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