Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1b4Q99ME6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1b4Q99ME6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1b4Q99ME6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms