Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gins4Q99LZ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms