Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cmtm3Q99LJ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm3Q99LJ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms