Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp16Q99LG0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp16Q99LG0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms