Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RtcbQ99LF4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RtcbQ99LF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RtcbQ99LF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms