Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nmd3Q99L48 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms