Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pagr1aQ99L02 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pagr1aQ99L02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms