Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf19Q99KP6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms