Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TirapQ99JY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TirapQ99JY1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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