Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apobec3Q99J72 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms