Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CsprsQ99388 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CsprsQ99388 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms