Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc8b1Q925Q3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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Slc8b1Q925Q3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms