Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim59Q922Y2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim59Q922Y2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms