Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp4Q921I6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms