Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Odf3Q920N1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf3Q920N1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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