Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med28Q920D3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med28Q920D3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms