Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snx18Q91ZR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snx18Q91ZR2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snx18Q91ZR2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx18Q91ZR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx18Q91ZR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx18Q91ZR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms